Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms