Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms