Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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