Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRS1Q15050 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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