Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD4Q14839 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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