Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC3Q14574 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms