Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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