Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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