Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms