Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms