Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A5P29400 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms