Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms