Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRHP20396 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRHP20396 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRHP20396 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRHP20396 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRHP20396 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRHP20396 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
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