Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYL1P12980 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms