Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2BP0DI82 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms