Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms