Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPLO60437 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPLO60437 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPLO60437 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PPLO60437 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PPLO60437 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPLO60437 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPLO60437 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPLO60437 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms