Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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SPAG9O60271 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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SPAG9O60271 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SPAG9O60271 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SPAG9O60271 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SPAG9O60271 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPAG9O60271 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
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