Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd1Q9Z2E2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd1Q9Z2E2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms