Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp4Q9Z1N6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms