Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfwd2Q9R1A8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfwd2Q9R1A8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfwd2Q9R1A8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfwd2Q9R1A8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms