Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpc6Q9R087 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc6Q9R087 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc6Q9R087 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc6Q9R087 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms