Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms