Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copg2Q9QXK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copg2Q9QXK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg2Q9QXK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg2Q9QXK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms