Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp3a41aQ9JMA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a41aQ9JMA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms