Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms