Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem3Q9JKE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trem3Q9JKE1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem3Q9JKE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms