Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl3Q9JKB1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl3Q9JKB1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl3Q9JKB1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uchl3Q9JKB1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms