Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga3Q9JJZ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnga3Q9JJZ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga3Q9JJZ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga3Q9JJZ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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