Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrnb2Q9ERK7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrnb2Q9ERK7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms