Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgap1Q9EPJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap1Q9EPJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgap1Q9EPJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms