Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tomm20Q9DCC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tomm20Q9DCC8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tomm20Q9DCC8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tomm20Q9DCC8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms