Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc3Q9D7J9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Echdc3Q9D7J9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Echdc3Q9D7J9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Echdc3Q9D7J9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Echdc3Q9D7J9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms