Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl40Q9D783 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl40Q9D783 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl40Q9D783 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms