Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13Q9D777 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf13Q9D777 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13Q9D777 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13Q9D777 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms