Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabl3Q9D4V7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rabl3Q9D4V7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabl3Q9D4V7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms