Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc6bQ9D289 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc6bQ9D289 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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