Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spc24Q9D083 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc24Q9D083 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc24Q9D083 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spc24Q9D083 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spc24Q9D083 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spc24Q9D083 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spc24Q9D083 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spc24Q9D083 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms