Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl55Q9CZ83 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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