Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc8Q9CYA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc8Q9CYA6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc8Q9CYA6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc8Q9CYA6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc8Q9CYA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc8Q9CYA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc8Q9CYA6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc8Q9CYA6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms