Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS4

Ints11, Integrator complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ints11Q9CWS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ints11Q9CWS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ints11Q9CWS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ints11Q9CWS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ints11Q9CWS4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ints11Q9CWS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ints11Q9CWS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ints11Q9CWS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ints11Q9CWS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms