Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot11Q9CWN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot11Q9CWN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot11Q9CWN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot11Q9CWN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms