Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
4931417E11RikQ9CR05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931417E11RikQ9CR05 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4931417E11RikQ9CR05 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4931417E11RikQ9CR05 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4931417E11RikQ9CR05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
4931417E11RikQ9CR05 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms