Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Tm4sf20Q9CQY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Tm4sf20Q9CQY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16,64■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,26
Tm4sf20Q9CQY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Tm4sf20Q9CQY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms