Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Riok2Q9CQS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Riok2Q9CQS5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms