Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med30Q9CQI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Med30Q9CQI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med30Q9CQI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med30Q9CQI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms