Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scd3Q99PL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scd3Q99PL7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scd3Q99PL7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms