Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Abcg5Q99PE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg5Q99PE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcg5Q99PE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcg5Q99PE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Abcg5Q99PE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms