Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nuf2Q99P69 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nuf2Q99P69 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nuf2Q99P69 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nuf2Q99P69 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1593.9 ms