Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms