Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fars2Q99M01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fars2Q99M01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fars2Q99M01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fars2Q99M01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms